Una situación que puede producirse con cierta frecuencia, es que el certificado digital instalado caduque y que incluso renovándolo, permanezca en el almacén de certificados junto con el válido y vigente, provocando que en Sage 50 a la hora de seleccionarlo, pueda llevar a confusión:

Si el certificado es el correcto, comprueba su vigencia y que no aparezca duplicado junto al antiguo con los siguientes pasos.
Una forma sencilla de acceder a la administración de certificados en tu equipo es dirigirse al menú Inicio - Buscar y teclear el comando certmgr.msc

Del mismo modo, puedes acceder con Win+R o botón derecho del ratón sobre el icono de inicio de Windows - Ejecutar, escribiendo el comando:

Accederás al almacén de certificados, donde seleccionar dentro del Personal, la carpeta Certificados y comprobar el detalle en el panel derecho de cada uno de ellos:

Entre esos detalles está la fecha de expiración, si el correspondiente a tu empresa y que posteriormente puedes seleccionar en Sage 50 para la Facturación certificada (Verifactu, No verifactu, TicketBAI) , para el Suministro Inmediato de Información - SII, para la Facturación electrónica) se encuentra caducado, elimínalo pulsando con el botón derecho del ratón sobre él y posteriormente importa el renovado en la FNMT por ejemplo.
Si te aparecen varios, elimina únicamente los caducados, aquellos que por su fecha de expiración ya no estén vigentes.
De ese modo evitarás incidencias a la hora de seleccionar y trabajar solamente con aquellos certificados vigentes y no revocados.