Al activar la Facturación Certificada debes indicar la fecha de activación y comienzo del proceso de certificación.
Desde el mantenimiento de Empresa - Add-ons - Facturación certificada se te solicita dicha Fecha de activación:

En esta pantalla, podrás indicar, por ejemplo, 01/10/2028. De ese modo puedes preconfigurar la facturación certificada para que se aplique únicamente cuando llegue la fecha indicada, que en este ejemplo sería la obligatoria.
Llegado el momento y la fecha indicada, se muestra un mensaje de confirmación. Este mensaje indica "A partir de este momento todas las facturas y tickets que se creen se certificarán”.
Con ello, podrás ir configurando el certificado digital en tus terminales, configurar las plantillas de impresión o las series de documentos.
Configura si es necesario, las series no certificables, etc., con la tranquilidad de que tus procesos de facturación no se verán alterados hasta dicha fecha.
Es decir, seguirías facturando exactamente igual que hasta ahora mientras llega esa fecha que has elegido.
Este control evita que existan facturas que deberían haberse certificado si están creadas con fechas anteriores. Por ello es muy importante configurar la fecha correctamente, de ese modo evitas crear facturas no certificadas.
Del mismo modo, si cuando indiques una fecha de activación, Sage 50 detecta que existen facturas creadas con fecha igual o superior. Estas no serán válidas ya que no estarían creadas siguiendo los controles necesarios de certificación.
Si fuera el caso, tendrías que eliminar dichas facturas y volverlas a crear para que de ese modo se certifiquen:
Como alternativa, siempre puedes editar la fecha elegida de activación en la empresa y elegir una posterior.